牦牛新鲜囊胚与玻璃化冻融囊胚转录组的比较分析

摘要：

旨在探讨牦牛在囊胚玻璃化冷冻前后转录组差异表达,明确玻璃化冷冻对牦牛囊胚基因表达谱的影响.采用体外受精生产的牦牛新鲜囊胚和玻璃化冻融囊胚为研究对象,分别提取总RNA,使用Smart-seq2方法进行扩增、构建文库、转录组测序(RNA-seq),以|log2(冻胚/鲜胚)|≥1和Q＜0.05为阈值筛选差异表达基因(DEG),并对DEGs进行GO功能富集和KEGG分析.结果表明,冷冻前后牦牛囊胚中分别检测到9 827和13 567个转录本.在两个文库共筛选出11 174个DEGs,其中有7 037个在冻融囊胚上调,4 137个下调.有10 538个DEGs显著富集(P＜0.05)到479条GO terms上,共涉及318条通路,其中真核生物的核糖体合成、剪接体和神经活性配体-受体互作等8条通路显著富集(P＜0.05).本研究利用RNA-seq技术分析了牦牛囊胚在玻璃化冷冻前后转录组变化,为探讨牦牛囊胚冷冻损伤机制及进一步完善冷冻方法提供理论依据.

关键词：牦牛、体外受精、囊胚、玻璃化冷冻、转录组测序

所属期刊栏目：49

分类号：S823.8+5.2(家畜)

资助基金：中央高校基本科研业务费专项资金项目2015NZYTD02

在线出版日期：2018-06-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：709-717