斯氏副柔线虫CAMK/TSSK蛋白激酶基因的克隆及其蛋白质结构与抗原表位预测分析

摘要：

为分析并预测斯氏副柔线虫免疫相关基因CTPK编码蛋白结构、功能以及其作为疫苗候选抗原的可能性,通过提取斯氏副柔线虫组织RNA,反转录合成cDNA,设计特异性引物以扩增CTPK基因的CDS区,并利用生物信息学软件对CTPK进行蛋白质结构分析和抗原表位预测.生物信息学分析表明,CTPK基因cDNA序列全长共519 bp,具有完整的开放阅读框(519 bp),编码173个氨基酸,相对分子质量和等电点大小分别为20.264 ku和9.53.结构分析发现,蛋白质无跨膜区,无规则卷曲构成二级结构的主要组分,亲水性氨基酸比例超过60％;抗原表位预测表明,CTPK蛋白是一种抗原性较高的亲水性蛋白,既含有较多潜在的B细胞抗原表位又存在较多的T细胞抗原表位.推测CTPK有望用作斯氏副柔线虫的免疫诊断抗原和疫苗候选抗原,本研究为骆驼斯氏副柔线虫生前诊断方法iELISA的建立和DNA疫苗的研究奠定了理论基础.

关键词：斯氏副柔线虫、CTPK基因、抗原表位、蛋白质结构预测、生物信息学分析、丝/苏氨酸蛋白激酶

所属期刊栏目：49

分类号：S852.731(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31260603;内蒙古自然科学基金2016MS0341

在线出版日期：2018-05-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：644-651