旋毛虫plancitoxin-1-like基因的序列分析与编码蛋白结构预测

摘要：

基因组预测旋毛虫拥有125种庞大的DNase Ⅱ家族蛋白,但只有plancitoxin-1唯一在C端含有一个保守的DNase Ⅱ活性位点(HKD基序).为研究旋毛虫plancitoxin-1基因的序列结构特征,以旋毛虫总RNA为模板进行RT-PCR,获得plancitoxin-1基因的序列,并利用生物信息学方法进行系统性分析.结果显示,扩增得到的核苷酸序列比GenBank中相关序列短210 bp,编码294个氨基酸,由20种氨基酸组成,重新命名为plancitoxin-1like,且氨基酸序列中在N端和C端都具有HKD基序.蛋白质理论相对分子质量为33.19 ku,等电点为9.17,是稳定存在的亲水性蛋白.Plancitoxin-1-like的氨基酸序列与其他物种DNase Ⅱ的相似性为35％左右.Plancitoxin-1-like含有4个N-糖基化位点、3个O-糖基化位点、31个磷酸化位点、17个B细胞线性结合位点和9个T细胞结合位点以及3个二硫键.二级结构中,α-螺旋占14.29％(42个),延伸链占28.23％(83个),无规卷曲占55.10％(162个).本研究成功克隆旋毛虫plancitoxin-1-like基因,对其序列结构进行分析,为进一步研究庞大的DNaseⅡ家族蛋白在旋毛虫发育和感染中的作用奠定基础.

关键词：旋毛虫、DNase Ⅱ、克隆、生物信息学

所属期刊栏目：49

分类号：S852.731(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31030064;国家自然科学基金面上项目31572489;河南科技大学博士启动基金13480071;河南省高等学校重点科研项目计划17A230009

在线出版日期：2018-03-21（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：218-222