保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落组成的初步研究

摘要：

通过高通量测序技术,初步研究保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落的组成.利用Andersen-6级撞击式空气微生物样品收集器,以5％的公绵羊血-琼脂培养基为采样介质收集保育猪舍气溶胶微生物,培养24 h后提取总DNA,扩增16S rDNA的V3-V4区,进一步采用Illumina MiSeq高通量测序研究保育猪舍不同粒径悬浮颗粒物细菌群落组成.各级采样样品共获得高质量序列301 065条,按照序列相似度97％的标准对高质量序列进行OTU的划分,得到2 104个OUT;通过α多样性分析,菌群丰富度由大及小依次为3_4s、3_2s、3_1s、3_6s、3_5s、3_3s,通过不同分析指数菌群多样性略有差异,但是多样性最高的为3_2s、3_5s,最低的为3_3s;菌落组成分析来看,细菌主要来自4个门、40个菌属,其中丰度最高的是变形菌门、厚壁菌门,总比例较高的菌属为变形菌门的不动杆菌属和丛毛单胞菌属,放线菌门的葡萄球菌属以及拟杆菌门的类香味菌属;利用UniFrac的PCoA分析3_1s、3_5s、3_4s、3_2s菌群相似度较高;3_6s、3_3s与其余样品菌群结构差异明显.可见,2.1～3.3 μm粒径悬浮颗粒细菌菌群丰富度最高,有14个菌属的细菌被报道对人和动物具有致病性,且各层级群落结构存在差异,相邻层级差别较大.

关键词：保育猪舍、悬浮颗粒物、细菌群落组成、高通量测序

所属期刊栏目：48

分类号：S851.24(动物医学（兽医学）)

资助基金：山东省现代农业产业技术体系生猪创新团队生产与环境控制岗位SDAIT-08-09;潍坊市科技发展计划2016GX045

在线出版日期：2018-04-02（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：2198-2204