水牛泌乳期与非泌乳期乳腺组织miRNAs表达谱鉴定及差异表达分析

摘要：

旨在鉴定分析水牛乳腺泌乳期和非泌乳期miRNA的表达谱和差异作用机制.采集水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织,利用Solexa测序技术构建2个时期miRNAs表达谱,鉴定前体miRNAs、成熟miRNAs和新miRNAs,分析miRNAs的第一偏好性核苷酸和染色体分布,发掘水牛泌乳期和非泌乳期高表达及差异表达miRNAs.结果显示,本研究构建了水牛泌乳期和非泌乳期乳腺组织2个miRNA表达谱,分别获得12 768 110和12 569 467条18～31 nt的高质量序列.测序确认了归属259个miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个pre-miRNAs及5个水牛特有的miRNAs.U是19和25 nt miRNAs的5'端最普遍的核苷酸.bbu-let-7b、bbu-let-7a、miR-26a和miR-21等miRNAs在2个时期均呈现高表达;bbu-miR-148a、143、200c、200a和bbu-let-7f等miRNAs在非泌乳期特异性高表达.bbu-miR-125b、29a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期特异性高表达.bbu-miR-148a、143、200a、141和30a-5p等miRNAs在泌乳期的表达量下降为非泌乳期的1/2以下.而bbu-miR-26a、29a、125b、99a和bbu-let-7c等miRNAs在泌乳期表达量大于或等于2倍非泌乳期丰度.本研究构建了水牛泌乳期以及非泌乳期乳腺组织2个miRNAs表达谱,测序确认了259个水牛miRNAs家族的359个成熟miRNAs和363个前体miRNAs,5个水牛特有miRNAs和10个高差异表达miRNAs,为进一步阐明奶水牛泌乳关键miRNAs作用机制奠定了基础.

关键词：水牛、泌乳期和非泌乳期、乳腺组织、miRNA表达谱、信号通路

所属期刊栏目：48

分类号：S823.83(家畜)

资助基金：国家863重点项目课题2013AA102504:广西科技厅项目桂科合14125008-2-13,桂科AD17129043,桂科AA16380026

在线出版日期：2017-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共13页

页码：1635-1647