荣昌猪胸腺素β15A(TMSB15A)cDNA全长克隆、序列信息及组织表达分析

摘要：

旨在克隆荣昌猪TMSB 15A基因全长,检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征,并对其基因的结构与功能进行分析.本研究利用RCAE (Rapid-amplification of cDNA ends)-PCR以及RT-PCR(Real-time quantitative PCR)技术克隆荣昌猪TMSB15A基因mRNA全长序列以及检测该基因在荣昌猪各组织中的表达特征.结果表明,荣昌猪TMSB 15A基因全长654 bp,其中CDS区长138 bp,编码45个氨基酸,5'UTR和3'UTR分别长86和430 bp.生物信息学分析表明,TMSB15A蛋白的理论分子量为5.2 ku,有10个带负电的氨基酸,9个带正电的氨基酸,蛋白理论等电点为5.3;预测TMSB15A蛋白无疏水区、信号肽结构、跨膜结构域,其主要在细胞质中发挥生理功能;TMSB15A蛋白的三级结构由α-螺旋和无规则卷曲构成.TMSB 15A基因编码的氨基酸序列与人、长臂猿以及黑猩猩的同源性最高,为97.8％,其次是骆驼和兔,为93.3％,与马的同源性最低,为11.1％.TMSB 15A在荣昌猪免疫相关组织脾和胸腺中表达量最高(P＜0.01),在淋巴结和肺中呈中等丰度表达,在心、肝、肾和肌肉中表达量较低.本试验为研究TMSB15A基因的功能奠定了基础,也为荣昌猪抗病育种研究提供了理论支撑.

关键词：昌猪、TMSB15A、RACE、基因克隆、序列分析、组织表达

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分类号：S828.2(家畜)

资助基金：重庆市农发资金项目13405;国家自然科学基金项目31201770;基本科研业务费项目2013cstc-jbky-00908;重庆市畜牧科学院基本科研业务费16435

在线出版日期：2017-11-01（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1602-1610