牛体外受精胚胎抗氧化相关的长链非编码RNA表达谱

摘要：

旨在探究培养液中添加3 mmol·L-1谷胱甘肽(Glutathione,GSH)对牛体外受精胚胎中长链非编码RNA(Long non-coding RNA,lncRNA)表达谱的影响.收集8～16-细胞期和桑椹期的胚胎,构建文库后测序,筛选差异lncRNAs,共表达分析后,获得的差异基因进行GO功能注释和KEGG通路分析;同时对lncRNA进行了顺式作用靶基因的预测及其功能分析;通过荧光定量PCR对8个lncRNAs表达水平进行检测,验证测序结果的准确性.测序共得到4 273个lncRNAs,通过对其表达量、长度和外显子个数分析表明,测序数据的可靠性较好.筛选共得到59个差异lncRNAs(其中23个在对照组(不添加GSH)上调,而在处理组(添加3 mmol·L-1GSH)下调;36个在对照组下调,而在处理组上调),在对照组和处理组中,59个lncRNAs分别与754和2 782个蛋白编码基因共表达,这些基因分别参与47和48个功能分类,且主要富集于5和13条信号通路.对23和36个差异lncRNAs临近的145和154个蛋白编码基因进行GO注释,结果表明,这些基因分别参与35和43个功能分类.14个lncRNAs共表达的差异基因参与谷胱甘肽代谢通路.综上表明,在培养液中添加GSH能导致胚胎lncRNA表达谱的变化.

关键词：谷胱甘肽、长链非编码RNA、转录组测序、共表达分析、靶基因

所属期刊栏目：48

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程“家畜胚胎工程与繁殖创新团队”ASTIP-IAS06-2017;国家科技支撑项目2012BAD12B01-2

在线出版日期：2017-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共12页

页码：1229-1240