尾分析法在不同规模群体中开展全基因组关联研究

摘要：

旨在将尾分析法与全基因组关联分析相结合,初步确定两尾选择的标准.首先,对样本量为2 000、1 500、1 000、500的群体进行全基因组关联分析(GWAS),探索群体规模大小对GWAS结果的影响,然后对各样本量两尾的20％、15％、12％、10％、8％、5％进行GWAS,探索两尾比例的大小对GWAS结果的影响.研究结果表明,检测出的显著关联SNP数目随群体规模及两尾比例的减小而减少.初步确定两尾选择标准为:遗传力为o.38左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为8％、1o％、10％、20％;遗传力为0.50左右的性状,样本量为2 000、1 500、1 000、500,两尾选择比例分别为5％、5％、10％、15％.以此标准为基础进行GWAS,既能有效检测出最显著SNP位点或区间,又能最大程度地降低研究成本,提高研究效率.

关键词：尾分析法、全基因组关联分析、遗传力、选择比例

所属期刊栏目：48

分类号：S828;S813.1(家畜)

资助基金：国家科技支撑计划项目2015BAD03B02-2;中国农业科学院科技创新工程ASTIP-IAS02;国家生猪产业技术体系CARS-36

在线出版日期：2017-08-14（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1181-1190