水牛卵母细胞GV/MⅡ期对应卵丘细胞miRNA差异表达分析

摘要：

本研究旨在建立水牛卵母细胞体外成熟培养前后GV/MⅡ(Germinal vesicle,GV)/(MetaphaseⅡ,MⅡ)期对应的卵丘细胞miRNA数据库,筛选两个时期差异表达的miRNAs,为进一步阐明miRNA通过调控卵丘细胞中基因表达进而在卵母细胞成熟过程中发挥的重要作用提供科学依据.分别收集水牛GV/MⅡ期的卵丘细胞,提取总RNA,利用Solexa测序技术获取小RNA测序数据,并进行生物信息学分析.结果表明:本研究成功构建了GV/MⅡ期卵丘细胞miRNA的表达谱,发现相对于GV期卵丘细胞,miRNA在MⅡ期卵丘细胞中表达差异显著上调的有24个,表达差异显著下调的有45个.采用qRT-PCR技术对随机筛选的8个miRNAs进行验证,证实其表达水平和RNA-seq分析结果相一致.结合靶基因预测和KEGG富集分析,获得了276条显著富集的信号通路;同时对富集前20的信号通路进行归纳总结,推测差异表达的miRNAs主要是通过细胞增殖、凋亡,物质代谢,细胞连接等途径在卵丘细胞中发挥作用.

关键词：水牛、卵丘细胞、miRNAs、Solexa测序、生物信息学

所属期刊栏目：48

分类号：S823.8+3.2(家畜)

资助基金：国家高技术研究发展计划“863”项目2011AA100607;国家自然科学基金项目31560633,31460282;广西科学基金杰青项目2012GXNSFFA060004;广西研究生教育创新计划项目YCBZ2015004

在线出版日期：2017-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：836-845