基于通路分析方法诠释肉鸡体重性状全基因组关联研究

摘要：

本研究旨在通过对体重和日增重进行基于通路的关联分析,以期获得影响体重和日增重的信号通路.对北京油鸡与科宝肉鸡F2资源群体14、28、56、93日龄体重及0～14、14～28、28～56、56～93日龄日增重分别进行全基因组关联分析,利用关联分析获得的显著性SNP位点进行基于通路的关联分析(SNP ratio test).结果表明,14日龄体重与类固醇激素的生物合成相关联(P＜0.05),56日龄体重与烟酸/烟酰胺的代谢相关联(P＜0.05),93日龄体重与糖酵解/糖异生相关(P＜0.05),且各日龄体重性状均与氨基酸的代谢过程相关联(P＜0.05).在增重最快的42～56日龄,与日增重相关的SNP富集到的通路最多,这些通路主要集中在TCA循环、类固醇合成、类固醇激素的生物合成、氧化磷酸化、磷酸肌醇代谢、甘油磷脂代谢等过程.在肉鸡体重迅速增长阶段类固醇激素的生物合成起到了重要作用,且氨基酸代谢过程与日增重显著相关.

关键词：SRT、通路、GWAS、体重、肉鸡

所属期刊栏目：48

分类号：S813.2(普通畜牧学)

资助基金：国家现代农业肉鸡产业技术体系CARS-42;中国农业科学院科技创新工程ASTIP-IAS04

在线出版日期：2017-11-29（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：810-817