奶牛分子系谱构建或亲权鉴定的微卫星标记筛选

摘要：

旨在利用较少的经过优化的遗传标记组合达到快速高效的亲缘鉴定,最终可有效应用于奶牛群体亲子鉴定与系谱构建.本研究从国际动物遗传学会(ISAG)数据库中初步选择了18个多态性较高的微卫星位点,经PCR优化验证获得可高效扩增的8个位点,并检测其在300头中国荷斯坦牛群体中的多态性分布.这些微卫星位点的亲子鉴定效力检测结果表明,8个标记平均等位基因数为14.63,平均多态性信息含量(PIC)为0.747,群体平均观察杂合度(Ho)为0.718,平均期望杂合度(He)为0.773.3种不同情形下进行亲子鉴定时8个位点的结合排除概率(CPE)均≥0.990.8对父子牛亲权鉴定结果表明,利用该8个标记可以识别并剔除系谱中的错误记录.结合排除概率的分析结果表明,当微卫星位点数增加至4个(TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103)时,3种不同情形下的CPE均≥0.949,可以满足个别案例牛亲子鉴定的要求.群体分子系谱构建的结果表明,当微卫星位点数大于或等于6个时,群体内近交系数和总群体近交系数均明显升高.因此,在生产实践中推荐使用TGLA227、TGLA122、BMC1207、BM103、INRA037、INRA134位点进行小规模群体(＜200)的分子系谱构建或亲权鉴定.

关键词：中国荷斯坦牛、微卫星位点、排除概率、亲子鉴定

所属期刊栏目：48

分类号：S823;S813.1(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31402054;山东省自然科学基金ZR2013CM013;山东省农业良种工程项目2016LZGC030;国家现代奶业产业技术体系CARS-37;山东省泰山学者种业创新人才团队计划培养项目2014LZ07-04

在线出版日期：2017-05-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：595-604