绵羊GDF9基因mRNA、DNA和调控区序列克隆及其在11个品种中遗传多态性检测

摘要：

本研究旨在克隆绵羊生长分化因子9 (Growth differentiation factor 9,GDF9)基因mRNA、DNA和调控区全序列,并检测其在11个绵羊品种中的遗传多态性,探究GDF9基因与绵羊多羔性状的关系.首先应用RACE和PCR技术克隆GDF9基因全长序列,其次利用SNaPshot分型技术检测11个绵羊品种GDF9基因遗传多态性.结果显示,克隆获得GDF9基因mRNA全长1 852 bp(GenBank序列号:KR063137),编码区两侧翼分别具有5'-UTR58 bp(1～58 nt)和3 ' UTR 432 bp(1 421～1 852 nt).进一步克隆获得长为2 898 bp的DNA序列和2 304 bp的调控区序列,分析发现调控区序列比数据库序列(NC_019462.1)多两个长片段.序列比对发现了已知突变G260A(G1)和调控区新突变-2078C＞G.分型结果显示,11个绵羊品种均不含FecGE、FecGH、FecGT、FecGF、FecGV突变,而G260A和-2078C＞G广泛存在于除草原型藏羊外的各绵羊品种中,G260A表现3种基因型(AA、BB和AB),首次在小尾寒羊和山谷型藏羊中检测到BB型突变纯合子.-2078C＞G也存在3种基因型,基因型结果表明该位点与G260A完全连锁.关联分析结果显示,小尾寒羊AB型产羔数显著高于AA型(P＜0.05).本研究完善了绵羊GDF9 mRNA、DNA和调控区全长序列,为进一步研究GDF9基因功能奠定了基础.同时在不同绵羊品种中发现了G260A和-2078C＞G突变,其中G260A作为潜在的有效遗传标记可用于提高绵羊的产羔数.

关键词：绵羊、GDF9基因、mRNA、调控区、遗传多态性

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分类号：S826;S821.2(家畜)

资助基金：中国农业科学院科技创新工程ASTIP-IAS13;国家肉羊产业技术体系专项CARS-39;国家自然科学基金项目31472078;国家转基因科技重大专项2016ZX08009-003-006,2016ZX08010-005-003;内蒙古自治区战略性新兴产业发展专项资金计划

在线出版日期：2016-09-22（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：1555-1564