四川地区鸡异刺线虫核糖体转录间隔区(ITS1/2)序列的遗传变异分析

摘要：

探讨四川地区鸡异刺线虫(Heterakis gallinarum)的遗传变异情况,为该地区鸡异刺线虫病的流行特征及防控提供基础资料.采用PCR扩增四川7个地区共59个鸡源鸡异刺线虫核糖体ITS1-5.8S-ITS2片段并测序,所得序列剪切5.8S序列后,得到ITS1/2序列,并分析ITS1/2序列的遗传多样性;同时利用GenBank中已公布的异刺属(Heterakis) ITS1/2序列信息,进行系统发育研究.结果如下:59条鸡异刺线虫ITS1/2序列相似性较高(98.9％～100.0％),ITS1序列间变异较ITS2大;59条序列有20个变异位点和14个单倍型(H1～H14);四川种群具有丰富的单倍型多样性(Hd=0.532)和较低的核苷酸多样性(π=0.000 94);种群间基因交流频繁(Nm=31.72),群体遗传分化不明显(Fst=0.007 82),以群体内变异为主(AMOVA分析值=99.22％);从单倍型网络图及进化树(MP和ML)分析来看,7个地理种群未形成显著的地理种群结构,但四川整体种群曾经历过种群扩张(Tajima's D=-2.553 31,Fu's Fs=-10.564;P＜0.05);进化树(MP和ML)能有效区分鸡异刺线虫与属内其他虫种.四川7个地区鸡的鸡异刺线虫基因交流频繁,遗传多样性较低.

关键词：鸡异刺线虫、四川、ITS1/2序列、遗传多样性

所属期刊栏目：47

分类号：S852.731(动物医学（兽医学）)

资助基金：四川农业大学学科“双支计划”SC-03571357

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：796-804