家兔不同发育阶段和组织中内参基因的稳定性分析

摘要：

本研究旨在筛选出新西兰白兔不同时期不同器官中表达最稳定的内参基因.以胚胎期(E28.5)、幼龄期(10 d)和成年期(A)3个阶段的新西兰白兔的肾、心和肝3种组织作为研究对象,按照RT-qPCR试验最低要求试验信息量(MIQE)的指导,运用RT-qPCR和在线内参基因稳定性评价工具RefFinder,比较6个常用的内参基因(GAPDH、HPR T1、18S rRNA、B2M、Sdha、-actin)mRNA的表达稳定性.结果表明,新西兰白兔的肝和肾组织中的6个内参基因在3个发育阶段最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、GAPDH,而在心组织中最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、Sdha.在新西兰白兔胚胎期的3种组织中,最稳定的3个内参基因依次是GAPDH、-actin、HPRT1,而在幼龄期和成年期最稳定的3个内参基因依次是HPRT1、GAPDH、β-actin.对新西兰白兔的3个发育阶段和3种组织的内参基因稳定性结果分析表明,最稳定的3个内参基因依次是β-actin、HPRT1、GAPDH.本研究证实,新西兰白兔不同的发育时期和组织中,最稳定的内参基因不同.推荐在进行新西兰白兔的相关试验时,可以选择上述表达最稳定的至少3个内参基因的几何平均数作为标准化相关RT-qPCR数据的指标,以确保试验组个体间的差异最小,和小变量的准确数据分析.

关键词：内参基因、表达稳定性、MIQE、RefFinder

所属期刊栏目：47

分类号：S829.1;S813.3(家畜)

资助基金：西南民族大学研究生学位点建设项目2014XWD-S0906

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：477-483