德保矮马X染色体选择信号筛选

摘要：

旨在对德保矮马(Debao pony)X染色体的选择信号进行筛选.本研究利用Illumina公司开发的马芯片Equine 65K SNP BeadChip,对德保矮马、伊犁马、蒙古马进行X染色体扫描,获得2 339个SNPs位点.通过群体分化系数FsT法和XP-EHH两种不同的方法,分别以伊犁马和蒙古马为对照群体对德保矮马进行X染色体选择信号检测.结果,筛选到两个受到较强选择区域4.0～39.9和87.1～123.5 Mb,包含64个“离群位点”.通过基因注释筛选到PHEX、BCOR、PNPLA4和GPC3等与生长和骨骼发育相关的基因.研究结果发现,德保矮马的选育过程中X染色体很多与生长相关的基因受到了强烈的选择,其中部分在马中未见报道,可以作为研究矮小性状的重要候选基因.

关键词：德保矮马、FST、XP-EHH、X染色体、选择信号

所属期刊栏目：46

分类号：S821;S821.21(家畜)

资助基金：农业科技创新项目ASTIP-IAS01;国家自然科学基金项目31272403

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：2161-2168