牛卵泡ODF1与ODF2转录组发育相关基因筛选及表达差异分析

摘要：

旨在从牛发情周期第一卵泡波中最大卵泡ODF1 (The largest follicle at onset of deviation)和第二大卵泡ODF2(The second largest follicle at onset of deviation)转录组水平上筛选卵泡发育差异表达基因.采集牛发情周期第一卵泡波ODF1和ODF2,分别分离颗粒细胞并提取总RNA,构建RNA文库,通过Illumina平台对ODF1和ODF2测序;筛选出ODF1与ODF2两个转录本之间比值大于2的差异表达基因,并采用qRT-PCR对筛选出的基因在牛发情周期内第一卵泡波优势卵泡(Dominant follicles,DF)和从属卵泡(Subordinate follicles,SF)颗粒细胞中功能验证.共获得8个卵泡发育差异表达基因,其中7个基因筛选自ODF1/ODF2(BEX2、UBN1、SIK1、SPARCL1、LOC784256、LOC789231和LOC785462),1个筛选自ODF2/ODF1 (SAFB2);qRT-PCR结果表明,BEX2、UBN1、LOC784256和LOC789231在DF中mRNA表达量极显著高于SF(P＜0.01),SAFB2在SF中mRNA表达量极显著高于DF(P＜0.01),SIK1和SPARCL1在SF中mRNA表达量显著高于DF(P＜0.05),虽然LOC785462在SF中mRNA表达量高于DF,但差异不显著(P＞0.05).qRT-PCR检测BEX2、UBN1、LOC784256、LOC789231和SAFB2的结果与高通量测序中该基因在ODF1和ODF2的RPKM的差异趋势基本一致,而SIK1、SPARCL1和LOC785462不一致.

关键词：牛、ODF1、ODF2、转录本、卵泡发育、基因

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分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31172211;农业部948项目2010-Z43;山西省横向协作与委托项目2010HX54;山西省回国留学人员科研资助项目2014-重点5;山西省科技攻关项目20130311027-2;山西省人事厅人才引进项目;山西农业大学引进人才博士科研启动费2014ZZ04;科研管理费资助重大项目;标志性成果培育项目71060003

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1961-1966