猪STARD3NL基因克隆和表达谱分析

摘要：

本研究旨在克隆猪STARD3NL (STARD3 N-terminal like protein)基因,对其基因结构进行分析,并研究该基因在猪不同组织中的表达特性.采用5 '和3'-RACE以及RT-PCR方法克隆猪STARD3NL基因,利用生物信息学方法预测蛋白结构,应用qRT-PCR技术检测组织表达特性.结果表明,猪STARD3NL基因的cDNA序列长度为1 319 bp(GenBank登录号:HQ634946),编码235个氨基酸,该氨基酸序列与其他物种相比一致性较高;进化树分析表明,猪STARD3NL氨基酸序列与牛和绵羊的关系较近,与斑马鱼的进化关系最远.ST ARD3NL氨基酸序列包含保守的MENTAL结构域,为疏水蛋白,包含4个跨膜螺旋区;二级结构主要是α-螺旋,占60％;该蛋白不存在信号肽,不是分泌蛋白;亚细胞定位显示,该蛋白存在于内质网的概率为39.1％.qRT-PCR分析表明,STARD3NL基因在所检测猪的14种组织均有表达,在肝中表达水平最高,在眼肌中的表达水平最低;莱芜猪和大长猪被圆环病毒感染后,STARD3NL基因在2种猪肺组织中的表达水平差异不显著(P＞0.05).研究结果将为进一步研究STARD3NL基因的结构和功能以及猪抗病育种提供资料.

关键词：猪、STARD3NL基因、克隆、猪圆环2型病毒

所属期刊栏目：49

分类号：S828;S813.3(家畜)

资助基金：山东省自然科学基金ZR2013CL012;国家自然科学基金31372333;临沂大学博士启动基金BS08019

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1678-1685