基于RNA-Seq识别山羊肉品质候选基因

摘要：

通过研究不同年龄和不同性别绒山羊背最长肌之间的差异表达基因,筛选影响绒山羊肉品质的候选基因.本研究基于RNA-Seq技术对4个绒山羊背最长肌的转录组进行高通量测序,在测序评估的基础上,对差异表达基因进行筛选、功能注释和富集分析.本研究通过CLC Genomics Workbench 6.0软件共找到263个候选基因,其中包含123个高表达有利基因和140个高表达有害基因.GO功能注释结果显示,高表达有利基因主要与骨骼肌的生长发育、细胞器的形成和蛋白结合功能有关;高表达有害基因主要与脂质代谢、细胞骨架以及结合功能有关.利用KEGG数据库作为参考,这些基因主要参与糖酵解/糖异生、丝裂原活化蛋白激酶、凝血-补体级联反应和色氨酸代谢等通路中.结合其他家畜基因组学研究,ADIPOQ、PDK4和CD36可能作为参与肉品质重要的候选基因.该结果为绒山羊肉品质的改善以及候选基因的研究提供了理论依据.

关键词：绒山羊、背最长肌、肉品质、RNA-Seq、候选基因

所属期刊栏目：46

分类号：S827.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金30960246;内蒙古自然科学基金2010Zd11;“内蒙古自治区草原英才”与“内蒙古自治区高等学校创新团队发展计划”NMGIRT1106;国家绒毛用羊现代农业产业技术体系CARS-40-05

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1300-1307