关岭牛MyoDI基因启动子上转录因子结合位点的筛选

摘要：

本研究旨在筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点.根据GenBank已公布的牛MyoDI基因的启动子序列,设计特异性PCR引物,扩增贵州关岭牛MyoDI基因的启动子区,构建重组克隆载体pUCM-T-MyoDI-pro,并对阳性质粒进行测序鉴定.再利用筛选试验和生物信息学分析筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上的转录因子结合位点.结果,筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有的转录因子结合位点有SATB1、Xbp、MEF2、Pax-3、Pbx1、PPAR、TFⅡD、COUP-TF、Gfi-1、HNF-1、HOX4C、NRF2 (ARE)、MEF1、RXR、SMUC、Snail、MyoD、VDR.结合在线软件分析和文献,最终筛选出关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点,这些转录因子对启动子活性起着重要的调控作用.结果显示,关岭牛MyoDI基因启动子上含有MyoD、TFIID、Pax3、MEF1、VDR和MEF2转录因子结合位点.

关键词：MyoDI基因、转录因子结合位点、启动子、细胞核提取物、生物信息学分析

所属期刊栏目：46

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家转基因生物新品种培育重大专项2013ZX08009-004;黔科合重大专项贵州畜禽种质资源保存、创新与利用字[2013]6008号;贵州省科技厅农业攻关项目黔科合NY字[2012]3008号;贵州大学研究生创新基金研农2014021

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1259-1267