传染性支气管炎病毒S1和N基因遗传变异频率的分析

摘要：

旨在探讨中国北方地区传染性支气管炎病毒(IBV)的流行和分子变异,进而探讨IBV的遗传演变规律.利用生物信息学方法对IBV纤突蛋白(S1)和核蛋白(N)编码基因进行分析比较.结果显示:2012-2013年发生在山东、天津等北方地区的IBV流行株高度同源,其S1基因核苷酸(氨基酸)相似性为94.0％～100％(93.1％～100％),N基因为98.4％～99.1％(98.1％～99.8％),而与经典疫苗株H120相似性均较低,且至少在S1基因的3个高变区产生了较多的点突变、缺失和插入,且变异集中在第53-150和250-290位,以高变区HVR I居多,GM/13在62-65位缺失4个氨基酸.进一步的分析表明:IBV流行株S1基因与1998年在我国北方流行的A2株核苷酸相似性最高,为94.9％～97.2％,年核苷酸(nt)变异频率平均为2.4 nt×10-3;而N基因则与LX4株相似性最高,为93.0％～93.5％,年变异频率平均为5.1 nt×10-3.IBV流行株可能是A2-like和LX4-like毒株的重组,且N基因的变异频率明显高于S1基因.

关键词：IBV、S1基因、N基因、遗传变异频率

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分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31372332;科技部农转资金SQ2013ECC600059;山东省科技攻关重点支持项目2009GG10009006;济南市成果转化支持项目2012CG92

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：989-997