猪T细胞受体β链的基因结构及其多样性分析

摘要：

设计猪TCRβ链基因的一对特异性引物,用RT-PCR法从合作小型猪外周血、淋巴结和脾淋巴细胞中高通量克隆和鉴定了82个猪TCRβ基因(简称STB).测序分析表明,克隆的猪TCRβ链的基因都含有可变的信号肽区和V区、高变的D区和J区以及恒定的C区的基因片段,绝大部分基因间的核苷酸序列组成都不完全相同,且具有十分复杂的多态性和多样性,基因间的相似性在36.6％～99.9％,这与TCRβ链的基本基因结构特征相一致.猪TCRβ基因的分子结构、遗传演化关系和归类分析发现,在同一类基因分子中其信号肽区、FR1区和CDR1区、FR2区和CDR2区以及FR3区之间的差异主要由V基因片段的多态性引起,而CDR3区的差异主要由其D、J基因片段的多样性造成.同时发现猪TCRβ与人类的遗传演化关系较近,大部分基因序列都能找到与人类对应的TRBV、TRBD、TRBJ基因片段,但又存在一定的差异性.这表明,猪TCRβ基因既有应对外界复杂微生物环境的免疫多样性分子遗传基础,也有物种间的相似性与特异性.

关键词：合作小型猪、TCRβ基因、生物信息学、多样性

所属期刊栏目：45

分类号：S852.4(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目31372423;甘肃省技术研究与开发专项1207TCYA025

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1874-1882