5株水禽细小病毒全基因组序列分析

摘要：

利用PCR技术扩增鹅细小病毒(GPV) ZJ、G3和LJY毒株与番鸭细小病毒(MDPV) DK和DYL毒株全基因组.序列分析结果表明,除LJY毒株非结构基因(NS)编码626个氨基酸外,其余4株NS全长1 884 bp,编码627个氨基酸;5株的结构基因(VP)全长均为2 199 bp,编码732个氨基酸.GPV、MDPV NS蛋白不同毒株之间相似性分别为95.9％～99.8％和96.8％～99.0％;而GPV与MDPV NS蛋白之间相似性为88.9％～90.4％.GPV、MDPV VP蛋白不同毒株之间的相似性分别为90.2％～100.0％和96.9％～99.3％,而GPV与MDPV VP蛋白之间的相似性为79.5％～81.6％,表明GPV抗原性不同于MDPV.MDPV与GPV NS蛋白均含有4个潜在的糖基化位点;在结构蛋白区域,MDPV VP含有8个潜在的糖基化位点,而GPV为6个糖基化位点,G3与LJY毒株分别缺失582-584 NTT和703-705 NRT潜在的糖基化位点.5株水禽细小病毒的进化分析表明,GPV、MDPV在进化上形成两个独立的分支,各个基因片段之间未发生重组.

关键词：鹅细小病毒、番鸭细小病毒、NS基因、VP基因、序列分析

所属期刊栏目：45

分类号：S852.659.2(动物医学（兽医学）)

资助基金：现代农业水禽产业技术体系岗位科学家专项CARS-43-10;国家自然科学基金面上项目31072132;公益行业专项201003012

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1837-1843