猪流行性腹泻病毒S、N和ORF3基因的遗传变异分析

摘要：

为探明2012-2013年在福建省流行猪流行性腹泻病毒(PEDV)结构蛋白的遗传变异情况,对7株PEDV流行毒株的S、N及ORF3基因进行克隆、测序及分析.结果表明:7株PEDV S基因之间的核苷酸相似性为98.6％～99.4％,与attenuated DR13弱毒株和CV777标准株的相似性分别为93.7％～94.1％和93.8％～94.1％;同CV777标准株比较,存在64个氨基酸突变,其中有3个氨基酸较以往国内外流行毒株的变异不一样,为新变异氨基酸,氨基酸的插入和缺失与2008年泰国NPPED2008_2株相似;7株PEDV毒株的N基因和ORF3基因之间核苷酸的相似性分别为96.5％～99.7％和99.7％～100％,与CV777标准株的相似性分别为96.6％～98.0％和96.6％～96.9％.遗传进化树表明:7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因与泰国流行毒株的亲缘关系较近,N基因与CV777标准株亲缘关系较近.7株PEDV毒株的S基因和ORF3基因变异程度较大,可能源于泰国及韩国的变异株.

关键词：猪流行性腹泻病毒、S基因、N基因、ORF3基因、变异分析

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分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：福建省公益性科研专项2013R1025-7;福建省农科院青年创新基金项目2012DQB-3

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1830-1836