运用四种线性模型对京海黄鸡上市体重进行全基因组关联分析

摘要：

旨在使用4种模型对京海黄鸡的16周龄体重进行全基因组关联分析(GWAS).试验以京海黄鸡母鸡为试验材料,通过60KSNP芯片分型,并使用2种线性回归模型和广义线性模型(GLM)、混合线性模型(MLM)4种模型对基因型数据和京海黄鸡16周龄体重进行关联分析.结果表明,虽然4种模型识别出的显著SNPs(P＜0.05)数目不同,但各有优缺点.此外,本研究共识别20个与京海黄鸡上市体重关联显著的SNPs(P＜0.05).这些SNPs主要分布于1、4、19、25和Z染色体上,其中,1号染色体50.6～53.6 Mb和Z染色体33.6～44.8 Mb区域是显著SNPs(P＜0.05)分布较为集中的区域.另外还有部分显著SNPs(P＜0.05)位于之前报道的影响鸡生长性状的QTL内.最后,本研究还找到了17个候选基因,同时还探讨了FAM184B、NCAPG和NLK的功能,所有的这些结果将促进鸡生长性状标记的研究.

关键词：京海黄鸡、上市体重、GWAS、GLM、MLM

所属期刊栏目：45

分类号：S831.2(家禽)

资助基金：国家肉鸡产业技术体系nycytx-42-G1-05;江苏省研究生创新工程CXLX12_0930;江苏省高校自然科学基金12KJB230003

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：1053-1059