猪SOCS3基因的克隆、生物信息分析及热应激条件下的表达

摘要：

鉴于细胞因子信号传导抑制因子3 (SOCS3)与多种疫病的发生密切相关,推测其可能在热应激致病中发挥重要作用.本研究克隆了猪SOCS3基因cDNA序列,发现SOCS3基因开放阅读框(ORF)长690 bp,编码229个氨基酸的前体蛋白.其与八眉猪、马、牛、人和小鼠的氨基酸序列一致性分别为98.2％、97.4％、96.5％、97.8％和96.4％.该蛋白分子量25.1 ku,等电点(PI)8.84,具有SOCS家族特异的中央SH2区、C末端40个氨基酸的SOCS box区及12个氨基酸的KIR结构区.荧光定量PCR结果显示,肠系膜淋巴结中SOCS3 mRNA在热应激的第3、6和9天显著下调(P≤0.05).但在胸腺和小肠黏膜中,尽管在第3天呈下降趋势,但在第6和第9天显著上调(P≤0.05).本研究成功克隆了猪SOCS3基因,发现其在热应激条件下表达量发生明显改变,并呈组织和时间依赖性.

关键词：猪、SOCS3、克隆、荧光定量、热应激

所属期刊栏目：45

分类号：S828;S813.3(家畜)

资助基金：国家自然科学基金31101862;中国博士后科学基金

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：1044-1052