不同猪源脑心肌炎病毒的分离、鉴定和全基因组序列分析

摘要：

为研究脑心肌炎病毒(enc ephalomyocarditis virus,EMCV)对不同猪种的感染情况,本研究应用改进的“细胞接种与RT PCR方法相结合”技术,成功分离到中国国内首株地方土猪源EMCV、首株家养野猪源EMCV和3株良种猪源EMCV,并进行了全基因组序列测定和分析.结果显示,5株EMCV分离毒株的基因组全长7 724～7 735 bp,彼此间核苷酸相似性为99.3％～99.8％,与其他不同动物源EMCV参考毒株的相似性为79.9％～99.9％,与国内猪源、鼠源毒株的相似性均在99.4％以上;各基因片段中,以VP1和2A变异幅度最大,VP2和3D最为保守;基于EMCV全基因组、ORF和VP1基因序列绘制的系统发育进化树显示,EMCV可分为G1、G2和G33个群,猪源EMCV主要分布在G1群和G2群,鼠源EMCV在G1群和G3群中均有分布;5株EMCV分离毒株与其他国内参考毒株同属于G1群.研究结果证实,地方土猪和家养野猪可感染EMCV并引起发病,提醒在进行地方品种养殖和野生动物家养时要充分考虑人兽共患疫病传播的生态学;鼠在不同猪种间交叉感染EMCV时,可能起到重要媒介作用;EMCV流行毒株存在较大的地域差异,其传播具有一定的区域限制性;EMCV在感染不同猪种时可能会发生某些氨基酸突变,以适应新的宿主.

关键词：脑心肌炎病毒、不同猪种、RT-PCR、全基因组、分子特征分析

所属期刊栏目：45

分类号：S852.659.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金31272567

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：967-973