基于高通量转录组测序的山羊睾丸和附睾头差异表达基因分析

摘要：

为探明山羊睾丸和附睾差异表达基因,挖掘与精子成熟和贮存密切相关的功能基因.采用Illumina HiSeqTM 2000高通量转录组测序RNA-seq技术对3只成年种公羊睾丸和附睾头进行测序,将组装得到的Unigene 比对到Nr、GO和KEGG数据库中注释,并进行差异表达基因聚类分析.结果显示,睾丸和附睾头Unigene总数分别为57 727个和51 395个,GO功能分类注释到生物过程、分子功能和细胞组成数据库中的分别有25 201、25 456和27 318个,其中差异表达基因数分别为9 150、9 172和10 003个;注释到KEGG通路中所有基因数23 222个,其中差异表达基因数8 219个,差异基因显著富集的信号通路:mRNA监视通路和mTOR信号通路;睾丸和附睾头中差异表达的基因共有24 592个,其中上调基因有8 420个,下调基因有16 172个.在附睾头中上调幅度最大的前3位:gDEFB124、gDEFB109和gDEFB 108,下调幅度最大的前3位:GTSF1L、SRRM1和FNDC8.附睾头中表达量最高的前3位基因依次为Lcn5、gDEFB 124和GPx5.睾丸中表达的基因数量大于附睾头中数量;β防御素家族、Lipocalin家族和GPx5可能在附睾头精子成熟、贮存和受精中发挥重要作用.

关键词：转录组、差异表达基因、睾丸、附睾头、公山羊

所属期刊栏目：45

分类号：S827.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金资助项目30871794

在线出版日期：2016-09-18（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共11页

页码：391-401