猪BPI基因部分cSNPs检测及其对蛋白结构功能的影响

摘要：

本试验以98头苏太猪为研究对象,检测BPI基因部分编码区的单核苷酸多态性(SNPs),并预测分析碱基突变对BPI蛋白结构和功能的影响.利用PCR-SSCP和PCR-RFLP结合测序的方法检测BPI基因外显子1、4和10的SNPs,运用生物信息学比较分析原蛋白和突变型蛋白的理化性质和结构.结果表明,以BPI基因cDNA序列作为参照,BPI外显子1、4和10存在6个SNPs,3个同义突变(c.24A＞G、c.54T＞C和c.522C＞T)和3个错义突变(c.433C＞T(Arg145Trp)、c.1060A＞G(Thr354Ala)和c.1151T＞G(Leu384Arg)).3种错义突变未改变BPI蛋白的理化性质、信号肽、跨膜区、糖基化位点以及二、三级结构,但是导致磷酸化位点的改变或存在其他潜在功能位点区域.Western blot试验发现,BPI蛋白的分子量为53 ku,苏太猪F18大肠杆菌抗性型猪的BPI蛋白表达量显著高于敏感型猪.猪BPI外显子4和10的碱基突变不同程度影响到蛋白功能,并可能对机体疾病的抗性/易感性产生影响.

关键词：猪、BPI基因、SNPs、生物信息学、蛋白结构和功能

所属期刊栏目：44

分类号：S828;S813.3(家畜)

资助基金：江苏高校优势学科建设工程资助项目;国家自然科学基金31172183;江苏省产学研前瞻性联合研究项目BY2012157;江苏省科技支撑计划农业BE2010371,BE2012330,苏州市科技支撑计划SN201013,SN201133

在线出版日期：2013-09-12（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1000-1007