影响猪免疫性状的单倍型关联分析

摘要：

旨在缩小课题组前期全基因组关联分析(Genome-wide Association Study,GWAS)结果区间范围,为下一步大规模群体验证提供有效候选基因.应用GWAS检验出的显著SNP标记构建单倍型,在大白猪×民猪F2设计资源群体内开展其与4个血常规指标(红细胞压积(Haematocrit,HCT)、血红蛋白(Hemoglobin,HGB)、平均红细胞血红蛋白量(Mean Corpuscular Hemoglobin,MCH)、平均红细胞体积(Mean Corpuscular Volume,MCV))和3个T细胞亚群指标(CD4+CD8-CD3+、CD4-CD8+CD3+和CD4+CD8-CD3+/CD4-CD8+CD3+)合计7个免疫性状指标的关联分析,寻找显著单倍型区段中的候选基因.分析结果表明:7号染色体上的3个单倍型区段均与T细胞亚群指标关联极显著,单倍型区段3(block7-3)与HGB及HCT关联极显著；8号染色体上3个单倍型区段均与MCH和MCV关联极显著,并由此定位5个候选基因:影响T细胞亚群指标的ABCF1和PPP1R10基因,影响HGB及HCT的GRM4基因,影响MCH及MCV的ALB和AFP基因.结合上述结果及基因功能,定位的5个基因可作为候选基因开展下一步研究.

关键词：免疫性状、单倍型、关联分析、猪

所属期刊栏目：44

分类号：S828;S813.3(家畜)

资助基金：国家十二五科技支撑计划项目2011BAD28B01;现代农业产业技术体系;中国农业科学院基本科研业务增项2012ZL069

在线出版日期：2013-10-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共10页

页码：843-852