山羊溶酶体α-AMA基因的克隆、生物信息学及组织表达谱分析

摘要：

本研究旨在对山羊溶酶体α-甘露糖苷酶(α-AMA)基因进行组织表达谱和生物信息学分析.参考牛α-AMA基因序列设计引物,采用PCR技术克隆山羊α-AMA基因序列,并利用荧光定量RT-PCR进行组织表达谱分析以及进行生物信息学预测.首次获得了山羊α-AMA基因,含有完整CDS编码区3000 bp,编码999个氨基酸,其中前50个氨基酸为信号肽序列.其编码区的核苷酸序列和预测氨基酸序列与牛的α-AMA相似性最高,分别为95.93％和94.79％.组织表达谱分析表明α-AMA在山羊各组织均不同程度的表达,其中在肺脏、肝脏、小脑表达量较高.生物信息学预测发现,α-AMA蛋白属于糖苷水解酶38家族成员,有2个保守的结构域,存在9个N-糖基化位点.SWISS-MODEL同源建模山羊α-AMA具有良好的可信度.本研究为探讨酶的作用机理及疯草解毒剂的研制提供了理论依据.

关键词：α-甘露糖苷酶、基因克隆、荧光定量PCR、生物信息学、同源建模

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分类号：S852.23(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金项目30871902;陕西省科技攻关项目2008k02-06-2

在线出版日期：2012-08-13（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：826-831