雏鸭肝炎病毒侵染下肝脏消减cDNA文库的构建及差异基因筛选

摘要：

本研究通过构建雏鸭肝脏消减cDNA文库,旨在筛选并鉴定与雏鸭病毒性肝炎相关的基因,对相关基因进行功能聚类分析进而探究其作用机理.利用抑制性消减杂交(Suppression subtraction hybridization,SSH)技术构建3日龄健康全同胞金定鸭人工感染雏鸭肝炎病毒(Duck hepatitis virus,DHV)与同期注射等量生理盐水差异表达基因的SSH-cDNA文库.对其中563个阳性克隆进行测序,共获得299条差异表达序列标签(Expressedsequence tags,ESTs).去除冗余的cDNA序列载体并聚类拼接后,进行核酸和蛋白质同源性的比较和功能聚类分析.结果表明:有70个不同的基因与ESTs具有高度的同源性(E值＜e-10,匹配长度＞150 bp,匹配度＞80％),且多数基因与细胞组分合成、信号转导以及病理状态下的生物学调控过程相关.Ⅰ型雏鸭病毒性肝炎的发生和发展是多基因多步骤的复杂过程,该结果为深入研究雏鸭肝炎病的分子调控机制提供基础.

关键词：雏鸭、雏鸭肝炎病毒、抑制性消减杂交、表达序列标签

所属期刊栏目：43

分类号：S834;S831.2(家禽)

资助基金：江苏省属高校自然科学基础研究面上项目07KJB230138;扬州大学科技创新培育基金项目2010CXJ056

在线出版日期：2012-05-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共9页

页码：211-219