禽波氏杆菌外膜蛋白A的克隆测序与生物信息分析

摘要：

本文旨在克隆禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA的编码基因,并预测OmpA蛋白二级结构和B细胞抗原表位,从而探讨禽波氏杆菌外膜蛋白OmpA在免疫保护中所起的作用.作者对禽波氏杆菌的外膜蛋白ompA基因进行PCR扩增、克隆及序列测定.应用生物信息学相关软件和方法,对禽波氏杆菌OmpA蛋白的二级结构和B细胞抗原表位进行预测.禽波氏杆菌ompA基因全长597 bp,编码199个氨基酸.二级结构以无规卷曲为主,有少量的α-螺旋和β-片层,少见β-转角;推测OmpA蛋白有5个B细胞优势抗原表位区域、2个糖基化位点.本研究为进一步分析禽波氏杆菌免疫机理、制备单克隆抗体和设计表位疫苗等奠定理论基础.

关键词：禽波氏杆菌、外膜蛋白A、二级结构、B细胞抗原表位、预测

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分类号：S852.61(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金30972183,30670114,30740077;山东省自然科学基金项目Y2006D09

在线出版日期：2011-07-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：544-550