5个重庆地方猪种遗传多样性的微卫星分析

摘要：

为了分析5个重庆地方猪种的遗传多样性和系统发生关系,采用FAO-ISAG联合推荐的27个微卫星标记,以有效等位基因数、期望杂合度和多态信息含量等遗传参数为指标,评估了品种内遗传变异.计算了F统计量、Nei氏遗传距离(Da)和Nei氏标准遗传距离(Ds)并进行UPGMA和M聚类分析及主成分分析,进而探讨了品种间的遗传分化和亲缘关系.结果,27个微卫星座位共检测到542个等位基因,其中43个等位基因为单一品种所特有.5个猪种的遗传多样性丰富:有效等位基因数(Ne)在9.493 3～11.028 0之间,期望杂合度(He)在0.889 7～0.909 1之间,多态信息含量(PIC)在0.868 9～0.892 6之间.F统计量分析表明,重庆地方猪种遗传分化明显(P<0.001),各群体内存在一定程度的近交.2种聚类方法以NJ法更为町靠.5个猪种聚为两类,荣昌猪、渠溪猪和合川猪为一类,罗盘山猪和盆周山地猪为一类.相关性分析表明,遗传距离与地理距离闯无显著的相关(P>0.05).该研究结果为重庆地方猪种的保护和利用提供了重要的理论依据.

关键词：地方猪种、遗传多样性、微卫星标记、遗传距离、聚类分析

所属期刊栏目：41

分类号：S828;Q345.6(家畜)

资助基金：重庆市自然科学重点基金项目CSTC2005BA1009;重庆市重大科技攻关项目CSTC2006AA1008;国家十一五科技支撑计划项目2007BA51B01,2007BA51B02

在线出版日期：2011-06-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：1515-1522