不同实验类型的基因表达数据聚类分析方法研究

摘要：

就基因芯片数据聚类分析中广泛应用的K-means算法对常见的2种类型的基因芯片数据上的应用进行研究.结果表明,不同类型的基因芯片数据适用于不同的预处理方式和不同的相似度.对于时间序列数据集,对数化转换后,相似度选择协方差所得结果最好.对于非时间序列数据集,对数转化最好,相似度选取欧氏距离、平方欧氏距离、马氏距离都比较好.

关键词：基因表达、聚类分析、K-means、相似度、数据预处理

所属期刊栏目：40

分类号：Q3-3;Q348

资助基金：国家自然科学基金30771534;教育部"长江学者和创新团队发展计划","猪抗病营养的分子机制"团队项目IRT0555-6

在线出版日期：2009-04-15（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：180-184