中国牛亚科家畜GH基因编码区序列的遗传变异研究

摘要：

采用PCR产物直接双向测序法,分段扩增普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛和亚洲水牛共5个牛种的GH基因,并拼接成编码区全序列,分析中国牛亚科家畜不同牛种GH基因编码区序列变异及其分子进化特征.结果表明,牛GH基因编码区序列全长654 bp,种间核苷酸突变率在0.1%～1.84%.5个牛种编码区序列定义了10种单倍型,瘤牛的单倍型多样性最高,大额牛和水牛均无单倍型多样性.GH基因编码区序列的密码子使用存在偏倚性,共发现了25个偏好性密码子.核苷酸的替代以转换为主,转换明显高于颠换,转换/颠换比为3.0.非同义突变位点远远少于同义突变位点,同义与非同义替代发生的速率比都小于或等于1,表明GH基因编码区序列不受达尔文正选择的影响.以GH基因单倍型序列为基础的分子进化树表明,水牛与普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间分化很明显;普通牛、瘤牛、牦牛、大额牛间序列分化并不明显,并且它们共同拥有一条相同的祖先核苷酸序列.说明中国牛亚科家畜GH基因编码区序列的变异相当贫乏,并且由于功能的约束表现得相当保守,进化速率相当缓慢.

关键词：牛亚科、生长激素基因、编码区序列、分子进化

所属期刊栏目：39

分类号：S823.2(家畜)

资助基金：国家自然科学基金30571323;江苏省高校自然科学基础研究项目08KJ230002

在线出版日期：2009-03-31（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1779-1784