大片吸虫组织蛋白酶L全长序列的获取及其生物信息学分析

摘要：

根据文库载体序列与原组织蛋白酶表达序列标签(EST)设计引物,以大片吸虫cDNA文库为模板,进行Touchdown PCR与梯度PCR相结合的扩增反应,扩增产物克隆入pMD18-T载体,经鉴定后测序,并采用生物信息学技术对序列进行开放阅读框(ORF)、编码氨基酸序列、蛋白质同源性比较、二级、三级结构等分析;结果所获序列全长990 bp,编码330个氨基酸,分子量36 771.2 U,等电点5.44;具有较明显的螺旋、片层和无规卷曲等二级结构,α螺旋占17.3%,β折叠占27.0%,无规卷曲占55.8%;具有2个较明显的跨膜区和2个疏水区,未发现明显的信号肽和糖基化位点;氨基酸序列同源性比对显示其属于半胱氨酸家族;三级结构同源建模预测显示其与组织蛋白酶K(PDB number 2f7dA)有49%的一致性.

关键词：大片吸虫、组织蛋白酶L、生物信息学

所属期刊栏目：39

分类号：S852.73+5;Q785(动物医学（兽医学）)

资助基金：国家自然科学基金30560111;国家自然科学基金桂科基0448001

在线出版日期：2008-05-27（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：206-211