用CPN60基因序列研究隐孢子虫种系发育关系

摘要：

本试验以编码线粒体功能性蛋白Chaperonin 60 (CPN60)的核基因作为研究对象,对隐孢子虫分离株CPN60基因进行扩增测序,用Clustal X1.81对扩增序列与GenBank相关参考序列进行比对,然后用PAUP4.0程序中邻接法(Neighbor-joining,NJ)、最大简约法(Parsimony, MP)构建基因树,同时用TREEPUZZLE程序Version 4.1构建最大似然树(Maximum likelihood, ML),以确定不同隐孢子虫虫株之间的进化关系,并以18S rRNA和HSP70基因构建的进化树作参照,评价CPN60是否更适合作为隐孢子虫基因分型和进化关系的分子标记.结果显示:基于CPN60构建的进化树将隐孢子虫分为两大类:C. baileyi和C. meleagridis处于一个分枝,C. hominis、C. suis、C. parvum牛基因型和C. parvum鼠基因型处于另一个分枝上.不同隐孢子虫之间的同源性介于96%～100%,能有效区分隐孢子虫不同基因型.因此,CPN60基因序列也可作为隐孢子虫分离株种系发育的遗传标记.

关键词：隐孢子虫、CPN60、种系发育

所属期刊栏目：38

分类号：R382.3;S852.72+3(医学寄生虫学)

资助基金：国家自然科学基金30371079;河南省高校创新人才培养项目豫教高[2004]294

在线出版日期：2008-03-05（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：1230-1234