猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株编码复制酶聚蛋白 ORF1的克隆及结构特征分析

摘要：

应用RT-PCR方法扩增了猪传染性胃肠炎病毒SC-Y株编码复制酶聚蛋白的ORF1序列,将其进行克隆、序列测定和分析.确认SC-Y株ORF1全长20 053 nt(GenBank收录号DQ390461).该序列包含2个ORF,其中ORF1a由12 053个核苷酸构成,可编码由4 018个氨基酸组成的多肽,ORF1b由8 036个核苷酸构成,可编码由2 678个氨基酸组成的多肽.对SC-Y与TGEV参考毒株及不同冠状病毒对应区进行序列比较,结果显示,SC-Y株与PUR46-MAD株的同源性最高,ORF1a的核苷酸同源性为99.5%,推导氨基酸同源性为99.2%,ORF1b的核苷酸及推导氨基酸同源性均为99.8%;不同冠状病毒之间ORF1b比ORF1a具有更高的保守性.

关键词：猪传染性胃肠炎病毒、编码复制酶聚蛋白ORF1

所属期刊栏目：38

分类号：S852.65+9.6(动物医学（兽医学）)

资助基金：教育部长江学者和创新团队发展计划IRT0555

在线出版日期：2007-09-17（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：822-826