先天性巨结肠与RET基因多态性和单倍型的关系

摘要：

目的 研究先天性巨结肠与RET基因多态性的关系,进一步推断主要的先天性巨结肠相关单倍型,并分析浙江汉族人群RET基因单核苷酸多态性的分布特点.方法 采集2005年至2007年浙江大学医学院附属儿童医院收治的123例汉族先天性巨结肠患儿以及194例健康体检儿童的外周血,并提取DNA.根据选取的RET基因单核苷酸多态性合成引物,行PCR扩增,经2%琼脂糖电泳证实PCR产物后,将PCR产物进一步纯化、测序.采用PHASE软件计算单倍型频率.将健康儿童RET基因各位点等位基因频率与文献和数据库已有的其他种族资料进行比较.RET基因和先天性巨结肠间关系的分析采用x2检验,以比值比及95%可信区间表示.结果 RET基因-5G＞A、-1A＞C、c135G＞A、c2307T＞G 4个位点的少见基因型AA、CC、AA、GG在先天性巨结肠患儿中的频率显著高于健康儿童(x2=57.775,20.469,57.040,38.869,P＜0.05).RET基因-5A、-1C、c135A、c2307G在先天性巨结肠患儿中等位基因频率显著高于健康儿童(x2=85.114,53.117,77.005,70.161,P＜0.05).RET基因各位点等位基因频率在不同类型先天性巨结肠间的差异无统计学意义(x2=0.048,0.265,0.395,0.027,P＞0.05).RET基因4个位点单倍型中ACAG占先天性巨结肠患儿的75.2%,显著高于健康儿童的38.7%(x2=62.776,P＜0.05).本组健康儿童RET基因-5A、c135A和c2307G位点的少见等位基因频率明显高于欧洲高加索人和非洲约鲁巴人(P＜0.05).结论 RET基因-5G＞A、-1A＞C、c135G＞A、c2307T＞G 4个位点多态性与浙江汉族人群先天性巨结肠发病明显相关,但与先天性巨结肠类型无关.RET基因4个位点单倍型中ACAG是浙江汉族人群的先天性巨结肠相关核心单倍型.浙江汉族人群的RET基因-5、c135和c2307位点的少见等位基因频率显著高于欧洲高加索人和非洲约鲁巴人.

关键词：先天性巨结肠、RET基因、多态性、单倍型

所属期刊栏目：09

分类号：R5(内科学)

资助基金：浙江省自然科学基金Y206003

在线出版日期：2011-01-07（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页码：421-425