关于核苷酸序列频谱分析方法的探讨

摘要：

由A、T、c、G四种字符组成的核苷酸序列本质上是生物分子的一种符号表示.在计算生物学中,常采用离散傅立叶变换进行频谱分析.根据核苷酸序列频率分布的特点和离散傅立叶变换所固有的"栅栏效应",本文提出采用调频z变换的分析方法,定义了相应的表达式,同时构造了短时调频z变换用于识别基因区域中的外显子部分和内含子部分.与已有的基因区域识别算法相比,该方法不需要依赖于训练样本序列.测试结果表明了该方法的有效性.

关键词：短时调频z变换、离散傅立叶变换、外显子、内含子、基因识别

所属期刊栏目：18

分类号：TP39(计算技术、计算机技术)

在线出版日期：2007-10-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共4页

页码：349-352