10.3760/cma.j.issn.1673-4912.2020.04.008
脓毒症患儿外周血中ATPase相关基因及关联长链非编码RNA的差异表达
目的:筛选和验证脓毒症患儿外周血中差异表达的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs),探讨其在儿童脓毒症发病机制中的作用。方法:选取2016年1月至12月在首都儿科研究所附属儿童医院ICU进行救治的3例脓毒症患儿和3例健康儿童的外周血标本,通过lncRNA测序技术筛选出差异表达的lncRNAs和mRNAs;对差异表达的lncRNAs进行靶基因预测,并根据GO分析结果选出与线粒体ATP合酶(F
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O-ATPase)活性相关的lncRNA-mRNA关系对;进一步扩大样本量,采用实时荧光定量逆转录-聚合酶链反应(qRT-PCR)技术对筛选结果中F
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O-ATPase活性相关的部分mRNAs及lncRNAs进行验证。
结果:测序结果显示,与健康儿童相比,脓毒症患儿外周血中差异表达的lncRNAs共252个(86个表达上调,166个表达下调),差异表达的mRNAs共2 652个(955个表达上调,1 697个表达下调);qRT-PCR验证结果显示:lncRNA ENST00000621933.1、ENST00000616950.1、ENST00000595748.1在脓毒症患儿中表达升高(
P<0.05),MT-ATP8、ATP5E以及lncRNA ENST00000624705.1和ENST00000615535.1在脓毒症患儿中表达降低(
P<0.05),与测序结果一致。
结论:脓毒症患儿外周血中存在差异表达的lncRNAs,以MT-ATP8及ATP5E作为靶基因的lncRNA ENST00000621933.1、ENST00000616950.1、ENST00000595748.1、ENST00000624705.1和ENST00000615535.1的表达水平可能与儿童脓毒症的发生发展有关。
脓毒症、长链非编码RNA、线粒体ATP合酶、儿童
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北京市医院管理局临床技术创新项目XM201412;北京市自然科学基金7172037;Beijing Municipal Administration of Hospitals Clinical Medicine Development of Special Funding SupportXM201412;Beijing Municipal Natural Science Foundation7172037
2023-05-30(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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