非酒精性脂肪性肝病特征基因的生物信息学研究与体外实验验证

摘要：

目的 运用生物信息学方法和体外实验,系统探讨非酒精性脂肪性肝病的特征基因.方法 基因表达综合数据库中检索和筛选非酒精性脂肪性肝病相关数据集,使用R软件分析该数据集中的差异基因表达,然后通过对该基因集的加权基因表达网络分析,确定与非酒精性脂肪性肝病发生有关的重要模块,最后我们将差异基因与加权基因表达网络分析得到的基因交联,得到疾病特征基因.分别利用随机森林、最小绝对值收敛和选择算子及支持向量机模型对疾病特征基因进行筛选,取三种不同机器学习的交集得到核心基因.采用棕榈酸钠将体外培养的大鼠正常肝细胞BRL细胞诱导分化为脂肪肝细胞模型,分别在不同时间点用Western Bolt法检测目的蛋白表达水平.结果 生物信息学分析确定了RPL19、CD59及BAX系非酒精性脂肪性肝病疾病最有诊断意义的核心基因.体外实验结果表明,棕榈酸钠分别诱导BRL细胞24小时、36小时均能使细胞内的CD59和BAX含量增加,RPL19含量降低,差异有统计学意义(P<0.01).结论 本研究提示RPL19、CD59及BAX系非酒精性脂肪性肝病疾病最有诊断意义的核心基因,为进一步研究非酒精性脂肪性肝病的进展机制提供了科学依据和新的见解.

关键词：机器学习、体外实验、非酒精性脂肪性肝病、核心基因

所属期刊栏目：27

分类号：R575.5(消化系及腹部疾病)

资助基金：安徽省重点研究与开发计划项目;安庆市立医院院级科研项目

在线出版日期：2023-04-03（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：1544-1549