肿瘤微环境在胰腺癌中的预后分析

摘要：

目的 探讨胰腺癌(PAAD)肿瘤微环境中与预后相关的潜在关键基因.方法 自癌症基因组图谱(TCGA)下载179例PAAD患者的基因表达谱和临床资料.使用ESTIMAT算法计算基质和免疫评分,根据基质和免疫评分将其分为高分组和低分组,生成Kaplan-Meier生存曲线.然后,使用limma包筛选高分组和低分组之间的差异表达基因(DEGs).通过韦恩图的交集找出DEGs的共同基因,利用DAVID数据库对上调基因进行功能富集分析,并使用Kaplan-Meier法验证这些基因的预后价值.结果 与高免疫评分组相比,低免疫评分的患者显示出更长的中位生存期(P=0.0369),但基质评分高低分组之间的预后没有统计学差异.高分组47个基因通常被上调,而低分组722个基因通常被下调,且47个上调基因中的31个与不良预后显著相关的基因.此外,发现LOC389332、ZDHHC8P1、WNK4、TLE6、DDC与肿瘤关系密切.功能富集分析显示上调基因主要参与细胞外基质、免疫应答和细胞黏附.结论 低免疫评分的患者显示出更长的中位生存期,本研究发现有31个与不良预后显著相关的基因,且LOC389332、ZDHHC8P1、WNK4、TLE6、DDC与肿瘤关系密切,这些基因的进一步研究可能是有价值的,有助于理解PAAD和微环境之间的相互作用,提供潜在的治疗靶点.

关键词：胰腺癌;癌症基因组图谱;肿瘤微环境;免疫/基质评分;预后

所属期刊栏目：26

分类号：R735.9;R576(肿瘤学)

资助基金：湖北省卫生计生科研基金资助;"医学信息分析及肿瘤诊疗"湖北省重点实验室开放课题

在线出版日期：2021-08-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：597-602