基于StarBase数据库分析lncRNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制

摘要：

目的 研究长链非编码RNA SNHG6在消化系统肿瘤中的表达及作用机制.方法 通过StarBase数据库不同分析功能,分析SNHG6在不同消化系统肿瘤中的表达水平;筛选出可能的下游靶基因,通过功能富集分析及KEGG通路富集分析,探讨SNHG6可能的作用机制;进一步探讨靶基因Eukaryotic Translation Initiation Factor 4 A3(EIF4A3)和SNHG6的相关性,同时分析EIF4A3在肝癌中的表达及预后分析.结果 SNHG6在除胰腺癌以外的消化系统肿瘤中均高表达,下游作用机制主要与剪切体、RNA转运、核糖体以及mRNA监测相关通路有关,同时与EIF4A3密切相关.EIF4A3和SNHG6在肝癌中明显正相关,并且EIF4A3在肝癌中明显高表达,生存分析提示EIF4A3与肝癌不良预后有关.结论 SNHG6在多数消化系统肿瘤中发挥促癌基因的作用,并且在肝癌中通过与EIF4A3相互作用,促进肝癌发生发展.

关键词：消化系统肿瘤、lncRNASNHG6、EIF4A3、StarBase数据库

所属期刊栏目：24

分类号：R735(肿瘤学)

资助基金：中国博士后科学基金面上项目2018M643129;广东省胃肠疾病重点实验室;广东省胃肠疾病生物工程中心;广东省科技计划项目2017B02029003

在线出版日期：2019-04-11（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：128-132,136