10.3969/j.issn.1009-8291.2023.08.016
肾透明细胞癌中检查点激酶2的转录组学分析
目的 利用生物信息学方法分析检查点激酶2(CHEK2)在肾透明细胞癌(ccRCC)中的表达、病理特征及预后,并探寻其涉及的分子信号通路及生物学功能.方法 从TCGA数据库下载ccRCC的转录组数据、临床病理数据及生存数据.使用R语言中的"survminer"包获得CHEK2表达量的最佳截值点,将患者分为高、低表达组,并评估CHEK2表达量与临床病理特征之间的关系.使用Cox回归分析探讨CHEK2在ccRCC中对患者预后的预测能力.通过富集分析(GSVA)探讨不同CHEK2表达水平时细胞通路的变化,并进一步研究CHEK2与免疫细胞浸润、免疫检查点分子表达的相关性.结果 CHEK2在ccRCC中表达水平显著高于正常组织(P<0.01).CHEK2的高表达与患者更高的T分期显著相关(P<0.01).生存分析表明CHEK2高表达的患者总生存期比低表达者显著缩短(P<0.001).单因素及多因素Cox回归分析表明CHEK2是影响患者生存的独立危险因素(HR=1.950,95%CI:1.490~2.570,P<0.001;HR=1.588,95%CI:1.185-2.127,P=0.002)0 GSVA 发现 CHEK2参与的通路有近曲小管碳酸氢盐重吸收、丙酸盐代谢、柠檬烯和蒎烯降解、脂肪酸代谢、原发性免疫缺陷、系统性红斑狼疮、p53信号通路、同源重组、DNA复制及错配修复等.相关性分析表明CHEK2可能与多种免疫细胞在ccRCC肿瘤组织中的浸润增多及多种免疫检查点分子上调有关.结论 CHEK2在ccRCC的高表达是不良预后的独立预测因素,可能参与调控肿瘤免疫浸润的相关事件,有望成为ccRCC治疗的新靶标.
检查点激酶2、肾透明细胞癌、免疫浸润、分子信号通路
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R737.1(肿瘤学)
2023-09-12(万方平台首次上网日期,不代表论文的发表时间)
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