基于ceRNA网络构建和免疫细胞浸润的肾乳头状细胞癌新预后特征分析

摘要：

目的 通过构建肾乳头状细胞癌(PRCC)相关ceRNA网络并进行分析,同时联合免疫细胞浸润,寻找新的PRCC治疗靶点和预后标志物.方法 从癌症基因组图谱(TCGA)数据库下载PRCC相关基因及其临床数据,并利用R软件筛选出差异表达的RNA分子构建ceRNA网络.进行单因素Cox分析、lasso回归分析以及多因素Cox分析筛选出与预后相关的基因并构建基因风险模型.通过CIBERSORT算法对免疫细胞进行评估,去除所有表达量为0的免疫细胞并对其进行单因素Cox分析、lasso回归分析以及多因素Cox分析,筛选出与预后相关的免疫细胞构建免疫细胞风险模型.最后将基因风险模型和免疫细胞风险模型进行共表达分析.结果 经过筛选后,我们发现了 11个重要的基因以及2个重要的免疫细胞,分别为ELN、COL1A1、EFEMP1、SYNGR3、DBT、KCTD15、RNF149、IKBIP、ATAD5、TCF4和 hsa-miR-133a-3p 这 11 个基因,以及巨噬细胞 M0和活化的CD4+记忆T细胞;共表达分析中,发现DBT与巨噬细胞M0(R=0.22,P=0.045)、TCF4与活化的CD4+记忆T细胞(R=0.37,P＜0.001)呈正相关.结论 筛选出的11个基因和2个免疫细胞是PRCC患者新的潜在治疗靶点以及预后标志物,共表达分析发现DBT与巨噬细胞M0、TCF4与活化的CD4+记忆T细胞呈正相关.

关键词：肾乳头状细胞癌、ceRNA网络、免疫细胞浸润、预后标志物、治疗靶点、基因

所属期刊栏目：27

分类号：R737.11(肿瘤学)

资助基金：山西省应用基础研究项目;山西省大学生创新创业训练计划项目

在线出版日期：2022-06-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：423-428,434