基因芯片筛选原发性膀胱癌差异表达基因

摘要：

目的 通过生物信息学分析方法对GSE13507的基因芯片进行分析,筛选膀胱癌相关的靶基因并进行验证.方法 从GEO数据库中下载编号为GSE13507的基因芯片,10例正常膀胱黏膜样本,58例正常外观膀胱癌周围组织样本,165例原发膀胱癌样本,23例复发性非肌层浸润性膀胱肿瘤样本.使用R软件读取并处理数据,构建蛋白互作网络,最后验证分析.结果 对样本数据进行差异分析显示,原发膀胱癌165例与正常外观膀胱癌周围组织的膀胱黏膜58例的差异表达基因共127个,其中膀胱癌周围组织上调基因123个,下调基因4个.通过蛋白互作网络筛选出6个核心基因MYL9、COL1A2、ACTG2、CDC20、ESM1、WDR72.在膀胱癌不同分期中6个核心基因表达均有差异,其中ESM1、MYL9、COLA2、ACTA2与预后生存相关.结论 筛选出的核心基因可能对膀胱癌发生发展的分子机制研究有所帮助.

关键词：原发性膀胱癌、生物信息学、基因芯片、差异基因

所属期刊栏目：26

分类号：R737.14(肿瘤学)

在线出版日期：2021-04-23（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共7页

页码：249-255