基于TCGA数据库的前列腺癌组织免疫细胞浸润模式预测

摘要：

目的 研究前列腺癌组织中免疫细胞的浸润模式及其与临床预后之间的相关性.方法 TCGA数据库下载前列腺癌mR-NA表达数据及临床资料,通过CIBERSORT软件预测前列腺癌组织中22种免疫细胞的浸润模式,应用R语言分析各种免疫细胞与生存的相关性.结果 TCGA数据库共下载mRNA表达数据540例,包含前列腺癌组织490例,正常前列腺组织50例,共检测mRNA 60483个,对所得矩阵文件校正后,应用CIBERSORT软件的反卷积法预测22种免疫细胞的构成比.结果 显示,前列腺癌组织中未活化的CD4记忆性T细胞(24.52％)、CD8 T淋巴细胞(11.21％)最为丰富.对免疫细胞的分布与临床预后相关性进行分析,结果显示随着前列腺患者年龄的增加,幼稚B细胞比例增加,且与肿瘤体积的大小密切相关.较高水平的M1型巨噬细胞与前列腺癌的淋巴结转移相关.结论 前列腺癌组织中存在免疫细胞不同程度的浸润,与肿瘤的发生发展及预后治疗密切相关.

关键词：前列腺癌、免疫细胞、TCGA数据库、预后

所属期刊栏目：25

分类号：R737.25(肿瘤学)

资助基金：甘肃省创新基地和人才计划-自然科学基金No.2016GS09086

在线出版日期：2020-11-10（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共5页

页码：890-894