膀胱尿路上皮癌与正常尿路上皮组织LncRNA表达谱差异性的研究

摘要：

目的 利用基因芯片技术,检测人膀胱尿路上皮癌与正常膀胱组织之间LncRNA表达谱的差异,对差异表达的LncRNA进行分类汇总,分析其生物学信息.方法 取人膀胱尿路上皮癌组织与配对的癌旁正常组织3对.分别提取尿路上皮癌组织及正常癌旁组织的总RNA并纯化RNA,与人LncRNA芯片杂交.使用Agilent Genespring GX (Agilent)软件分析尿路上皮癌组织及正常癌旁组织的LncRNA表达情况.结果 人膀胱尿路上皮癌组织与配对的癌旁正常组织的LncRNA表达谱差异明显.以P＜0.05,上调或下调信号差异大于2倍变化为标准,与正常膀胱组织比较,共筛选出差异表达基因1 122个,其中上调基因734个,下调基因388个.结论膀胱尿路上皮癌的发生发展是一个涉及多基因调控、多条染色体参与的复杂过程.所获得的膀胱癌差异表达LncRNA,尤其差异表达明显的上调基因AK124776、lincRNA-RAB12-1、KRT8P25、RP11-474J18.4、AC000110.1、KRT8P13、KRT8P10、BC072678等、下调基因nc-HOXB9-206、RP11-160A10.2、nc-HOXA11-86、nc-HOXD10-7、nc-HOXB9-205、CES4、nc HOXD12-3等,考虑上述上调、下调基因对于膀胱癌发生的分子机制及膀胱癌的临床早期诊疗具有重要意义.

关键词：LncRNA、基因芯片、膀胱、尿路上皮癌、表达谱

所属期刊栏目：21

分类号：R34(人体生物化学、分子生物学)

资助基金：国家自然科学基金资助项目81172426;上海市教委创新重点项目12ZZ034

在线出版日期：2016-10-09（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共6页

页码：550-555