肾透明细胞癌中具有预后预测价值免疫相关基因的筛选

摘要：

目的 挖掘肾透明细胞癌(ccRCC)中具有预后预测价值的免疫相关基因.方法 从遗传病控制(GDC)网站下载534例ccRCC基因表达数据和相应的临床信息,以ESTIMATE算法对所下载的数据进行免疫评分和基质评分.按照评分高低分为高分组和低分组,研究其对总生存和无病生存期的影响,确定差异表达与预后显著相关基因.应用DAVID数据库对差异表达基因进行功能富集分析,采用Kaplan-Meier法进行生存分析,在STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,并在GEO数据集中进一步验证.结果 挖掘出12个可预测ccRCC无病生存期的免疫微环境相关基因(BCL3、F3、HLF、HNRNPAB、SHOX2、SNRPB2、USP5、ALX1、FAM50A、USP39、DBF4、SPIN1)(P<0.05),1个蛋白互作网络枢纽基因(RAC3).其中DBF4、USP5和HLF基因均出现于TCGA、GEO数据库和差异表达的预后PPI网络中.结论 本研究所筛选的核心免疫微环境相关基因可能与ccRCC预后相关,其中HLF、USP5、DBF4和RAC3有望成为ccRCC治疗的新靶点,其具体机制尚需进一步实验阐明.

关键词：肾透明细胞癌、免疫微环境、预后

所属期刊栏目：14

分类号：R737.11;R318;R681.8

资助基金：国家自然科学基金;苏州市科技计划项目

在线出版日期：2022-06-08（万方平台首次上网日期，不代表论文的发表时间）

页数：共8页

页码：8-15